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utiliser_le_systeme_batch_ge_depuis_le_centre_de_calcul [2019/05/31 15:18]
Quentin LE BOULC'H
utiliser_le_systeme_batch_ge_depuis_le_centre_de_calcul [2019/08/01 16:19] (Version actuelle)
David BOUVET [Se connecter à une machine d'accueil]
Ligne 47: Ligne 47:
 > ssh [-X] <​loginname>​@cca.in2p3.fr > ssh [-X] <​loginname>​@cca.in2p3.fr
 </​code>​ </​code>​
-Pour utiliser SL6 plutôt que CentOS 7, se connecter à cca6.in2p3.fr. ​+
 ====  Positionnement de l'​environnement GE  ==== ====  Positionnement de l'​environnement GE  ====
  
Ligne 737: Ligne 737:
 -l os=cl7 -pe openmpi <​number_of_cores>​ -q <​QueueName>  ​ -l os=cl7 -pe openmpi <​number_of_cores>​ -q <​QueueName>  ​
 </​code>​ </​code>​
-Avec dans le script :\\+Avec dans le script ​(pour OpenMPI 2.1.1 par exemple):\\
 <​code>​ <​code>​
- ​source /usr/local/shared/bin/openmpi_env.sh+ ​source /pbs/software/centos-7-x86_64/openmpi/ccenv.sh 2.1.1
  
  ​mpiexec -n $NSLOTS phello  ​mpiexec -n $NSLOTS phello
Ligne 760: Ligne 760:
 Avec dans le script :\\ Avec dans le script :\\
 <​code>​ <​code>​
-export MPICH_HOME=/usr/lib64/mpich +source ​/pbs/software/centos-7-x86_64/mpich2/ccenv.sh 3.2 
-export PATH=${MPICH_HOME}/bin:​${PATH} +mpiexec -iface ib0 -np $NSLOTS phello ​
-export MANPATH=${MPICH_HOME}/man:​${MANPATH} +
-MPIEXEC="/​usr/​lib64/​mpich/​bin/​mpiexec+
-${MPIEXEC} ​-iface ib0 -np $NSLOTS phello ​+
 </​code>​ </​code>​
 Compilation : Compilation :
Ligne 776: Ligne 773:
 \\ \\
 \\ \\
- 
 ====  Array job  ==== ====  Array job  ====
  
  • utiliser_le_systeme_batch_ge_depuis_le_centre_de_calcul.1559308722.txt.gz
  • Dernière modification: 2019/05/31 15:18
  • par Quentin LE BOULC'H